Sekcja powstała jesienią 1958 roku. Jej założycielem był – Zenon Wiśniewski. Szkoleniem najmłodszego pokolenia pływaków zajmowała się wielokrotna mistrzyni i rekordzistka Polski, Halina Dzik-Petrusewicz. Przy stadionie Pogoni wybudowano basen który oddano do użytku 20 lipca 1959 roku. Odbywało się na nim wiele imprez pływackich.

Największą turniejem pływaków na tym basenie była III Ogólnopolska Spartakiada rozegrana w czerwcu 1964 roku. Wśród najlepszych zawodniczek wyróżnić możemy, Mirosławę Czernię, Iwonę Wejkszę i Danutę Petrusewicz. Wśród zawodników na wyróżnienie zasługują: Artur Wójt, Andrzej Sala, Zenon Mazur.

Jednak czołowym pływakiem był Michał Pociej. W 1966 r. podczas Halowych Mistrzostw Polski w Gorzowie zdobył brązowy medal. W 1967 ustanowił rekord Polski na 50 metrów stylem dowolnym.Rok później zdobył Wicemistrzostwo Polski w wyścigach na 50 i 100 metrów stylem dowolnym.

Po dwunastoletniej działalności sekcja została przeniesiona do Neptuna.

Opracowano na podstawie książki Floriana Krygiera: 50 Lat Pogoni Szczecin